U sastavu Ministarstva graditeljstva i prostornog uređenja HNK je i Zavod za prostorno uređenje i zaštitu okoliša.
Zavod obavlja:
planiranje, programiranje, projektiranje, korištenje, valorizaciju i zaštitu prostora i mjera za njihovo ostvarivanje,
izradu prostorno-planske i urbanističko-tehničke dokumentacija, osim poslova koji su zakonom stavljeni u nadležnost Federacije i općine,
izradu prostornog plana Kantona,
izradu programa uređenja građevinskog zemljišta,
i druge poslove u skladu sa zakonom.